公共卫生专家多年来要求医师减少抗生素用量，以避免病菌产生适应性，演化出据抗药性新菌株。

抗生素须慎用的另一大原因在于，部分抗生素将病人脏器内的所有细菌几乎一网打尽，使得病人极易感染易在全国各大医院中爆发的传染病。

梭状芽胞桿菌（clostridium difficile）是种引发轻则腹痛腹泻、重则致命的结肠感染等胃肠疾病的常见病菌。2009年确诊，33万6000例梭状芽孢桿菌感染，较2000年感染病例几乎高出一倍。

湾区几乎每所医院均有梭状芽胞桿菌感染爆发，在年老与免疫系统低下病人居多的疗养院，这类爆发更是常见。

加州太平洋医疗中心去年便因梭状芽胞桿菌感染爆发，而暂时关闭整座医院。该院感染控制与预防经理凯伦．安德森说：「这是每所医院持续存在的问题。我敢确定，在那里看到过，梭状芽胞桿菌是新型抗药性葡萄球菌感染的说法，但这的确是事实。」

传染病专家认为，梭状芽胞桿菌感染是个现代问题。这种细菌一直存在于环境与人体正常、健康的内脏中。但在过去2、30年抗生素普及使用以来，梭状芽胞桿菌感染成为一种普遍常见疾病。

旧金山加大传染病专家邱华彦教授说：「病人通常只出现腹泻，最多只会觉得很讨厌而已。但对于老年或体弱的患者，可能因此出现结肠感染，而导致生命危险。梭状芽胞桿菌是环境中无所不在的一部分，我们无法摆脱它。它可能寄生在很多人体内，因此有一部分人从来不会因它得病。」