波士顿恐怖袭击发生后，纽约市立刻提高警戒，在多个重要地段加强警力。市警总局局长凯利16日透露，警局正在考虑是否要取消本周末纽约市两项长跑赛事。

市长彭博对于在「爱国日」进行恐怖袭击非常愤慨，「外国势力、国内内讧、恐怖集团从来没有停止过破坏美国的自由，他们也不会停止」。彭博16日中午在通报纽约市防恐情况时指出，纽约市从九一一恐怖袭击后建立了全世界最大、最复杂的城市反恐体系，还不断更新各种防恐装备和加强人力备置。纽约市各处的录像监视器、车牌辨识系统(license plate readers)、生化和雷达探测等装备可以让警察更快地发现可疑事物并展开调查，希望国内安全部持续拨款，让纽约市保持设备更新能力。

纽约市多个重要地标、宗教场所、酒店和地铁站在波士顿恐怖袭击发生后已经加强警力安排，市警总局正与联邦调查局(FBI)等机构合作，探查任何恐怖袭击迹象。彭博和凯利希望民众不要放松警惕，看到周围有任何可疑包裹，就立刻拨打911报警。纽约派了两位警佐前往波士顿协助调查，但凯利拒绝透露警佐的任何信息。

虽然目前尚没有收到任何可能针对纽约市进行恐怖袭击的讯息，凯利表示，警局在「重新评估」本周末将举行的两场马拉松赛事，一是9/11「家庭日」5000米长跑，另一个是中央公园的四哩筹款义跑。凯利坦承，「我们没有办法阻挡每一场袭击，就像昨天一样。但必须继续竭尽全力。请民众张开眼睛，如果看到可疑包裹，立刻报警。」除了按正常程序审视安全防卫工作，警局会从不同角度再次查看警卫工作。

除了本周末的两场马拉松赛事，纽约市5月将迎来多场全市性的运动赛事。包括5月5日3万2000名自行车骑士将进行五区自行车赛、5月18日1万5000人将参加布碌崙的半程马拉松赛。有关方面透露，除了市警总局安排的警力外，组织者还聘请了其他私人保安公司。同时，有消息透露，警方将向组织者多收取交通控制方面的费用，现行价格约是100万元。