若联邦政府持续关闭，湾区两座国家实验室也将自21日起关闭，导致7000人被迫休假停薪。

位于利佛摩市的劳伦斯利佛摩国家实验室，是规模最大的实验室，共6500多名员工。其中，1000多人在利佛摩园区内的萨蒂亚国家实验室工作。

两座实验室均进行核武测试，保持国家核武库存，并进行另类能源研究。

选区包括上述两座实验室的都布林联邦众议员萨瓦维尔（Eric Swalwell）表示，实验室依靠现行合约的资金运作，资金将在一周内耗尽。他说，两座实验室已接到通知，「21日是接受政府服务合约拨款的最后一天。」

湾区还有科研项目跨多个领域的劳伦斯柏克莱国家实验室，研究员、工程师与辅助员工共4200人左右。柏克莱实验室发言人表示，该实验室未有在21日关闭的计画。

在中半岛蒙洛公园市的史丹福直线加速器中心，员工超过1500人。该中心一名发言人表示，中心在21日维持营运。

湾区四座国家实验室均为联邦政府所有，但由大学或私营企业等包商营运；因此，不会向令近80万人停职的联邦政府一样停摆。

全国共有七座国家实验室，雇员人数超过三万人，其中大多为研究员与工程师。

另三座国家实验室为新墨西哥的洛斯阿拉莫斯国家实验室，田纳西的橡树岭国家实验室与伊利诺斯的阿尔贡国家实验室。

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